Pelaajien on ostettava Mega-Sena-liput osallistuakseen arvontaan. Aloitakseen pelaajien on valittava kuusi numeroa yhteensä 60 numerosta. Valinta voidaan tehdä manuaalisesti tai käyttämällä Quick Pick -työkalua, joka tekee valinnat satunnaisesti ja automaattisesti. Pelaajien tulee valita kukin numero vain kerran. Quick Pick -työkalun avulla pelaajien on ensin valittava, kuinka monta lippua he aikovat ostaa. Se voi olla 1, 3, 5, 10 tai 15 lippua ostoa kohden.
Valittuaan onnennumerot pelaajat voivat valita, kuinka monta arvontaa he haluavat osallistua samoilla lipuilla. Mitä enemmän arvontoja on, sitä enemmän liput maksavat. Teknisesti useamman tasapelin valitseminen lisää myös pelaajien voittomahdollisuuksia.
Mega-Sena tarjoaa myös 5 % alennuksen lipun hinnasta 20 arvonnan valitseville pelaajille. Pelaajat voivat sitten napsauttaa kassavaihtoehtoa ja maksaa liput. Yleensä niitä on erilaisia maksuvaihtoehtoja saatavilla, jolloin pelaajat voivat valita heille sopivimman.
Kun pelaajat ovat ostaneet liput, he eivät voi muuttaa valintojaan millään tavalla. Seuraava askel on odottaa arvontoja ja tarkistaa, onko jollakin lipulla numeroita, jotka vastaavat arvontoja. Vastaavat numerot johtavat voittoihin. Mitä enemmän numeroita täsmäävät, sitä enemmän voittosumma on. Arvonnan tulokset lähetetään yleensä sähköpostitse kaikille lippunsa netistä ostaville kilpailijoille, jotka ovat hyödyllisiä niille, jotka eivät pysty seuraamaan arvontoja.